研究方向為海洋微藻的進化基因組學，在此期間獲“中國科學院院長特別獎”和“國家海洋科學技術獎一等獎”。2006年7月至2010年12月在美國賓州州立大學比較基因組學和生物信息學研究中心，從事計算生物學和基因組學研究工作。2011年被中國科學院北京生命科學研究院聘為“百人計劃”研究員。現任中科院北京生科院科研部副主任、中科院北京生命科學大型儀器區域中心辦公室主任、計算生物學聯合研究中心秘書長、中國生物工程學會計算生物學專業委員會副主任。在國際SCI刊物Briefings in Bioinformatics、Genomics錛 Proteomics & Bioinformatics、BMC Evolutionary Biology、Medicine in Microecology和Hereditas等雜志擔任副主編或編委。近年來，
投資理財
先後主持國家自然科學基金7項（青年、面上、培育、重點和優青等）、國家重點研發計劃課題3項、國防科技創新特區項目、中國科學院“科技創新交叉與合作團隊”項目和中科院院長特別獎基金等。近年來，圍繞著“計算基因學”研究方向，建立了一系列原創性的生物信息學算法和工具，並在環形非編碼RNA和微生物組領域取得重要進展。在Nature Communications、Gut、Genome Biology、Trends in Genetics、ISME J、Current Biology和Nucleic Acids Res 等刊物上發表通訊作者論文30餘篇，平均影響因子超過10；研究論文總引用次數超過5000次（H-index 36），其中多篇入選ESI高被引論文；參與編寫中英文專著4部；連續三年榮獲“中國科學院優秀導師獎”（2017，2018，2019）；培養的研究生已有5人次獲得“中科院院長獎”和“中科院優秀博士學位論文”。文章引用見Google Scholarhttps://scholar.google.co.jp/citations?user=F-Mh6hgAAAAJ團隊在微生物組領域有非常前沿的成果產出。宏基因組曾報導過其中兩篇Gut（IF 17.9）和1篇NC（IF 11.878）如下：Gut：人體最初的微生物起源與生殖健康 孕期健康對孩子至關重要Gut：人體口腔菌群的穩定性和動態變化規律 科普：口腔微生物“你的大能量，
